連接酶通常是包括“連接酶”這個字，就如DNA連接酶是將脫氧核糖核酸（DNA）片段連接。其他普遍的名稱包括“合成酶”，因為這些酶是用作合成新的分子，或當它們是將二氧化碳加入一個分子時則稱為“羧化酶”。
需要留意的是“合成酶”是與合酶有所分別，合成酶是會使用三磷酸腺苷（ATP），但合酶不會使用ATP且是屬于裂合酶。
