1.顱內原發腫瘤
單發的顱內轉移瘤非常容易與腦內惡性膠質瘤、淋巴瘤等相混淆，兩者均可表現為抽搐、顱內壓增高等癥狀。原發腫瘤一般病史較長，往往以肢體活動、語言障礙為先發癥狀，顱內轉移瘤患者多以持續性頭痛伴陣發性加劇為主訴，CT掃描示腫瘤一般較小，周邊水腫面積與腫瘤面積比相差懸殊。
2.腦膿腫
少數較大的顱內轉移瘤中心可有壞死、液化，但其周邊常呈折線鋸齒狀。腦膿腫患者有發熱癥狀，身體其他部位有外傷或感染病史。CT或MRI示腦膿腫呈比較光滑的圓形，似面窩狀。
3.腦囊蟲病
患者表現為顱內壓增高的癥狀，既往可有禽畜接觸史或食用“米豬肉”史，CT或MRI可見彌漫性分布不均的腦小片水腫，有環形或半環形鈣化，散在多發，部分可見頭節。
4.腦結核瘤
腦結核瘤是中樞神經系統感染結核桿菌后形成的一種肉芽腫樣病變，常繼發于身體其他部位結核。患者除顱高壓、癲癇癥狀外，多有發熱、盜汗、消瘦等全身癥狀。CT或MRI示病灶呈單發或多發類圓形，周邊強化明顯。