生物氧化時，氧化呼吸鏈由4種具有傳遞電子能力的復合體組成，線粒體內膜蛋白質用膽酸等去污劑處理及離子交換層析分離，可純化出內膜的呼吸鏈成分，得到這4種仍具有傳遞電子功能的蛋白質－酶復合體（complex），分別為復合體Ⅰ，復合體Ⅱ，復合體Ⅲ，復合體Ⅳ，各含有不同的組分。其中復合體Ⅰ又稱為NADH-泛醌還原酶，在三羧酸循環和脂酸β－氧化等過程的脫氫酶催化反應中，大部分代謝物脫下的2H是由氧化型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸（nicotinamide adenine dinucleotide，NAD）接受，形成還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸（NADHH）。NADHH的電子經復合體Ⅰ繼續傳遞氧化。復合體Ⅰ由三部分組成，成“L“形，其一臂突出線粒體基質，由兩部分組成，其中之一就是黃素蛋白。而FMN即為黃素蛋白的輔基。
亦稱核黃素-5-磷酸。廣泛分布于生物界中。和黃素腺嘌呤二核苷酸（FAD）一樣，對呼吸等生物氧化過程的電子傳遞起著重要的作用，即作為黃素酶組的輔基，以與酶蛋白（apo－enzyme）的結合狀態，參與電子從底物向電子接受體傳遞。它和核黃素有同樣的吸收光譜，在生物體內通過核黃素激酶的作用，經由核黃素和ATP合成。可為磷酸酶水解，而形成核黃素和磷酸。