鼠疫桿菌的檢驗必須嚴格執行烈性菌管理規則，注意防止氣溶膠感染或防蚤叮咬。動物實驗應有防護設備，實驗用過培養物及器材應及時消毒。取檢材涂片，用甲醇或酒精乙醚混合液固定5～10分鐘，然后進行革氏或美蘭染色，鏡檢觀察鼠疫桿菌的形態特征。將檢材劃線接種于普通瓊脂平板上，龍膽紫血瓊脂平板及厚金格爾（hottinger）瓊脂平板上。28℃孵育48小時后觀察菌落特征，挑取可疑菌落，涂片、染色、鏡檢。必要時，接種厚金格爾斜面和肉湯，作噬菌體裂解、凝集或沉淀試驗等進一步鑒定。確診第一例鼠疫報告時，須作豚鼠皮下或擦皮接種試驗。