須詳細詢問病史、全面體格檢查（包括直腸指檢）、尿液和前列腺按摩液常規檢查。推薦應用NIH慢性前列腺炎癥狀指數進行癥狀評分。推薦“兩杯法”或“四杯法”進行病原體定位試驗。
為明確診斷及鑒別診斷，可選擇的檢查有：精液分析或細菌培養、前列腺特異性抗原、尿細胞學、經腹或經直腸B超（包括殘余尿測定）、尿流率、尿動力學、CT、MRI、尿道膀胱鏡檢查和前列腺穿刺活檢等。
