大多數糖尿病個案涉及多種基因，而這些不同的基因都可能會使患上2型糖尿病的幾率上升。如果同卵雙胞胎的其中一人有糖尿病，另一人患上糖尿病的機會高于90%，然而非同卵的兄弟姐妹的幾率只有25%至50%。到2011年為止，共發現了超過36個基因都可能增加罹患2型糖尿病的風險。然而，即使全部這些基因加在一起，亦只占誘發糖尿病的整體遺傳因素中的10%。舉例來說，可使發病風險增加1.5倍的等位基因TCF7L2為常見基因變異中擁有最高風險的基因。多數與糖尿病有關的基因都與β細胞功能有關。
在一部分罕見的糖尿病個案中，發病原因是因單個基因出現異常而引起的（稱為單基因型糖尿病或“特殊類型糖尿病”）。其中包括年輕人成人型糖尿病（maturity onset diabetes of the young, MODY）、矮妖精貌綜合征（Leprechaunis）、Rabson-Mendenhall綜合征等等。其中年輕人成人型糖尿病占年輕糖尿病患者個案總和的1%至5% [2]