隨著內鏡治療技術的發展，近年來內鏡下消融治療（EATs）已應用于臨床。EATs可分為熱消融、化學消融和機械消融三大類。熱消融又包括多極電凝術（MPEC）、氬光凝固法（APC）和激光（KTP、YAG等）。化學消融主要指光動力學治療（PDT），其基本原理為先將光敏劑如血紫質等靜脈注射使其定位于食管的化生或異型增生或腺癌上皮，通過非熱力的光化學反應而致局部組織壞死。機械消融則在內鏡下運用萃吸、切除等方法。EATs加PPIs抑酸治療是目前治療BE及BE伴異型增生的有效方法，使BE上皮消失或逆轉為鱗狀上皮，療效可達70%～100%，并發癥發生率較低。但EATs使用時間不長，病例數不多，隨訪時間較短，其療效還需時間檢驗，而且對化生上皮逆轉后能否降低腺癌發生率尚待進一步評價。有明顯食管狹窄者可進行食管探條或球囊擴張術，但其療效較短暫，可能需多次擴張。