實驗步驟 | 第 1 天
顯微針的制備四分體解剖針可以通過手工拉制細玻璃絲或使用「技術和方案 23, 制備四分體解剖針」中描述的光學纖維玻璃絲來制備。將會演示針的準備過程并且提供給你一些必需品,以便你可以自己制備。針和固定器也可通過商業途徑獲得。
用消解酶處理在開始本課程前 3 天,指導教師會把二倍體菌株 3-3 接到孢子形成培養基上。在顯微鏡下觀察形成孢子的培養物,并辨別未形成孢子的細胞以及四孢子子囊,以及少于四個孢子的子囊。每個學生將安排 3 天時間用 4 個活的孢子來制備 20 個解剖了的四分體,并用消解酶的方法來處理細胞。在「技術和方案 22,四分體解剖」中描述了四分體的顯微操作。
第 3 天
完成四分體的解剖。
第 5 天
每個學生必須用無菌扁平牙簽和模板(附錄 D,平板劃線模板)制備兩塊上面有 4 個活孢子菌落(每塊板有 10 個四分體)的母板。每個平板上包括兩個親本對照菌株。
在 30°C 下過夜培養。
第 6 天
影印平板上的四分體到測試培養基影印母板到以下培養基上:YPD、SC-leu、SC-arg、SC-ade、SC-trp、YPD+cyh 和 6 個以上的 YPD 平板(在開始前見下面的提示)。第一塊 YPD 平板作為新鮮的母板留作后用。其余的 YPD 平板用于將孢子菌落與測試菌株的交配。所有平板在 30°C 下培養。
提示:從一塊原平板做 12 次影印是一個大的工作量。在 6 次影印后,在影印模具上放一塊新的絨墊,并用母板做新的影印。因為用了兩次母板,第一次用絨墊要輕些影印,以便第二次影印時在原板上還保留有細胞。每次影印后要檢查一下,應該能看到其相應于母板上排列方式的輕微的細胞沉淀。如果沒有看到,要再試一次。另一種方法:
孢子菌落接種到含有無菌水的一個微量滴定盤中,然后用多頭接種器,即多頭轉接技術 (froggingtechnique) 將這些細胞轉移到不同測試板上。在^J 和的菌株間能發生交叉給養(cross-feeding), 因此輕微地影印到 SC-trp 板上是重要的。
交配型和等位基因測試菌的準備在 5 ml 的 YPD 培養基中培養測試菌株 3-4 到 3-13。或者,在 YPD 培養基上制備大塊的測試菌株的菌斑。30°C 下過夜培養。
第 7 天
交配型測試菌苔的準備使用其中一種方法。
a. 離心 5 ml 的 3-4 和 3-5 菌株培養物(桌面離心機 2000r/min,5 min)。在一個無菌的旋蓋試管中用 4 mlYPD 重懸浮菌體。加 0.15 ml 無菌水和 0.15 ml 重懸的菌株 3-4 的培養物到兩塊 SD 平板(剩余細胞儲備在 4°C)。用無菌棒將菌體涂勻,水平放置平板,使平板晾干。同樣處理菌株 3-5。
b. 用收集棒從 YPD 平板上刮取菌株 3-4 的一個新鮮菌斑,重懸于 4 ml 的 YPD 液體培養基中。過夜培養使之細胞濃度達到過飽和。涂 0.2 ml 菌液到兩塊 SD 平板上。同樣處理菌株 3-5。液體揮干后,影印平板到菌苔上。
等位基因和互補測試菌苔的準備除 MATa 和 MATa 型測試菌株被置于同一塊平板外,這些菌苔的準備與在「交配型菌苔」中的方法同樣。準備 4 種類型的測試菌苔,并且每種準備兩塊。在 SC-ura-his 平板上涂開 arg4 測試菌苔(菌株 3-6 與 3-7 混合,菌株 3-8 與 3-9 混合)。對于 Trp 互補菌苔(菌株 3-10 與 3-11 混合,菌株 3-12 與 3-13 混合),將細胞涂到 SC-trp 平板上。在影印平板到菌苔上以前,讓液體變干。
復制平板到測試菌苔用 6 個前一天制備的四分體的 YPD 影印物作源影印到 6 個測試菌苔上。對于每個測試菌苔,均用一個新的絨墊,把 YPD 平板印在絨墊上,然后將測試菌苔平板印在絨墊上,以此來轉移四分體到測試菌苔上。測試平板在 30°C 下培養過夜。
第 9 天
影印 SC-um-his 平板上的等位基因測試菌苔到 SC-arg 平板上并且冷藏。在當日結束時,由實驗室助理收集平板,用 STRATAGENE 公司的 Stmtalmker7500|uJ 的紫外線燈(254nm) 照射。
分析交配型測試平板和 Trp 互補平板的生長情況。由于 tr 和缺陷菌株能與缺陷菌株共生,需要影印 SC-trp 平板到一塊新的 SC-trp 平板上并在第二天分析。
第 10/11 天
分析 arg4 等位基因測試平板及 Trp 互補平板。
第 11 天
確定在雜交中每種對標記發生分離后的 PD、NPD 和 T 型四分體的數量。在本實驗末尾的記錄單上記錄 PD/NPD/T 型資料。此外,記錄每個標記的第二次分裂分離的頻率。通過搜尋在酵母基因組數據庫(SGD;http://www.pathway,yeastgenome.org/) 中的關于每個基因圖譜的信息來確定每個基因與著絲粒間的距離。用收集的資料計算:
1) 每個分析基因與所有其他分析基因間的圖譜距離 2) 每個基因與它的著絲粒間距離(如何與 SGD 提供的信息相比較?)3) 所有我們研究的等位基因的基因轉換頻率(3:1 或 1:3 分離)第 14 天準備提交資料
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