GPC 是基于體積排阻的分離機理,通過具有分子篩性質的固定相,用來分離分子量不同的物質,并可分析分子體積不同、化學性質相同的高分子同系物。GPC 的柱填料為凝膠,是一種表面惰性物質,具有三維網狀結構,含有許多不同尺寸的孔穴,不具有吸附、分配和離子交換作用。
當含有多種分子的樣品溶液緩慢流經凝膠色譜柱時,各種分子滲入凝膠微孔的程度不同,大分子受排阻不能進入微孔,分子越小則進入微孔越深,因而滯留時間不同。試樣中的各組分按照分子大小順序洗脫,大分子的油脂、色素(葉綠素、葉黃素)、生物堿、聚合物等先被淋洗出來;農藥等分子量較小,后被淋洗出來。通過收集經分離的含有農藥成分的洗脫液,再與檢測器聯用進行檢測分析。