凝膠電泳儀需要使用形成為平板的凝膠,該凝膠通常由純化后的海藻瓊脂糖瓊脂糖制成。
瓊脂糖凝膠制成多孔基質,各種大小的帶電分子可以通過多孔基質以不同的速度傳播。在將凝膠倒入模具之前,將一種稱為溴化乙錠(EtBr)的化學物質添加到凝膠溶液中。
如果要分離的DNA或蛋白質分子很小,則可能需要使用聚丙烯酰胺凝膠代替瓊脂糖。使用聚丙烯酰胺時請多加注意,因為它具有神經毒性。
將特殊的梳子放在瓊脂糖凝膠模具中,然后在固化后小心地取出。首先將DNA片段或其他分子樣品與一種特殊的上樣染料混合后放在此處。該樣染料只是跟蹤DNA的運動,因為它是不可見的,否則。
還有一個包含所謂的DNA梯子或標記物的孔。這可作為具有已知條帶大小的高質量模板,用于與正在研究的DNA樣品進行大小比較。一旦施加電場,這些帶負電荷的分子將通過凝膠朝著正極行進。