凝膠色譜儀凝膠的特征參數有排阻極限、滲透極限、吸水率、凝膠粒徑、床體積和空隙體積等。
一、排阻極限：
指不能進入凝膠色譜柱凝膠顆粒孔內的zui小分子的相對分子質量。
二、滲透極限：
指能夠完全進入凝膠色譜柱凝膠顆粒孔內的zui大分子的相對分子質量。
三、吸水率（溶脹率）：
吸水率 = [（m溶脹平衡后凝膠－m干凝膠）/ m干凝膠]×100%
四、凝膠粒徑：
軟質凝膠粒徑較大，為50～150μm。硬質凝膠粒徑較小，為5～50μm。凝膠粒徑越小，理論塔板當量高度（HETP）越小，分離效率越高。
五、床體積：
指1g干凝膠溶脹后所占的體積。
六、空隙體積：
指凝膠色譜柱凝膠顆粒之間的空隙體積，即死體積V0。
空隙體積一般用平均相對分子質量為2000的水溶性藍葡聚糖測定。