分子排阻色譜，有時又叫“尺寸排阻色譜”或“體積排阻色譜”，是根據待測組分的分子大小進行分離的一種液相色譜技術。
分子排阻色譜法的分離原理為分子篩機制，色譜柱多以親水硅膠、凝膠或經過修飾的凝膠，如葡聚糖凝膠和瓊脂糖凝膠等為填充劑，這些填充劑表面分布著不同孔徑尺寸的孔。分子進入色譜柱后，它們中的不同組分按其分子大小進入相應的孔內，大于所有孔徑的分子不能進入填充劑顆粒內部，在色譜過程中不被保留，最早被流動相洗脫至柱外，表現為保留時間較短；小于所有孔徑的分子能自由進入填充劑表面的所有孔徑，在色譜柱中滯留時間較長，表現為保留時間較長；其余分子則按分子大小依次被洗脫