乳腺佩吉特病的組織發生有兩種學說。一種是嗜表皮遷移學說，認為佩吉特細胞起源于乳腺深部的導管癌，通過輸乳管遷移至乳頭上皮，形成所謂的“佩吉特樣遷移”；有大量數據支持乳腺佩吉特病的上述起源理論。另一種是表皮內轉化學說，認為佩吉特細胞是由乳頭大導管表皮基底層內的多潛能細胞原位轉化而來；支持該理論的主要依據是有少數乳腺佩吉特病患者僅為單純乳頭佩吉特病變，不伴有乳腺深部病灶。
