藍氏見弟鞭毛蟲為單細胞原蟲，主要寄生在小腸上段，尤其是十二指腸內，有時也寄生在膽囊、膽道和肝膽管內。藍氏賈弟鞭毛蟲及發育分為滋養體和包囊兩個階段。滋養體形如縱切的半個倒置梨子。前端鈍圓，后段細尖，背部隆起腹扁而平，腹面前半部向內凹陷形成吸盤，借此吸附于腸壁上，有4對鞭毛，活蟲體借助鞭毛擺動作活潑的翻滾運動。滋養體無胞口，通過體表滲透作用攝取營養，以二裂法繁殖。包囊橢圓形，成熟包囊有4個細胞核，是該蟲的傳播階段，隨大便排出體外通過糞—口途徑傳播。包囊壁較厚，對外界抵抗力氣強度，在水中可存活1—3個月糞便中能活10天以上。包囊可在蒼蠅、蟑螂消化道內存活，故它們也是傳播媒介。
本病分布甚廣，全球均有發生。美國1992—1997年監測結果表明全國發病率為9.5/10萬。國內分布廣泛，1988—1992年全國30省市調查結果顯示總患病率約2.52％，兒童明顯高于成人，發病高峰為5—9歲，新疆、西藏、河南患病率高，吉林、遼寧、內蒙古患病率低。病人和包囊攜帶者為傳染源，通過包囊污染水源或食物而傳播。