骨質疏松癥除了主要與絕經和老年有關的原發性骨質疏松外，還可能由多種疾病引起，稱為繼發性骨質疏松癥。可能引起骨質疏松的常見疾病有：
1.內分泌疾病
糖尿病（1型、2型）、甲狀旁腺功能亢進癥、庫欣綜合征（Cushingsyndrome）、性腺功能減退癥、甲狀腺功能亢進癥、垂體泌乳素瘤、腺垂體功能減退癥等。
2.結締組織疾病
系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、干燥綜合征、皮肌炎、混合性結締組織病等。
3.慢性腎臟疾病
多種慢性腎臟疾病導致腎性骨營養不良。
4.胃腸疾病和營養性疾病
吸收不良綜合征、胃腸大部切除術后、慢性胰腺疾病、慢性肝臟疾患、營養不良癥、長期靜脈營養支持治療等。
5.血液系統疾病
白血病、淋巴瘤、多發性骨髓瘤、高雪病和骨髓異常增殖綜合征等。
6.神經肌肉系統疾病
各種原因所致的偏癱、截癱、運動功能障礙、肌營養不良癥、僵人綜合征和肌強直綜合征等。
7.長期制動
如長期臥床或太空旅行。
8.器官移植術后
9.常期使用下列藥物
糖皮質激素、免疫抑制劑、肝素、抗驚厥藥、抗癌藥、含鋁抗酸劑、甲狀腺激素、慢性氟中毒、促性腺激素釋放激素類似物（GnRHa）或腎衰用透析液等。