SIgA是粘膜抗感染的重要因素，但是粘膜抗感染還包括少量滲出的IgM和IgG，還有細胞免疫的作用。由SIgA缺陷病人常可檢測出針對牛奶或其他食物蛋白的沉淀抗體和自身抗體，說明機體對抗原蛋白質吸收異常，同時也存在免疫調節系統的功能紊亂。一般來說血清IgA缺陷病人常伴有SIgA缺陷，反之亦然。說明在機體中血清IgA和SIgA之間有某種生物相關性。
最近也有報導少數SIgA缺陷病人的血清IgA水平正常，因而分別檢查血清中和分泌液中IgA水平還是有必要的。目前用免疫比濁法可較精確地測定分泌液中IgA時和IgM和IgC水平。在用單向免疫擴散和免疫比濁法定量IgA時，因抗血清是針對這兩型共有的α鏈的，故不能區分SIgA和血清來源的IgA。而應用抗分泌小體的抗體用酶免疫分析法，可區分血清IgA和分泌型IgA，并可對SIgA進行定量。