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  • 發布時間:2019-09-12 14:59 原文鏈接: 制備體外剪接反應用HeLa細胞核和胞質S100提取物實驗

               

    實驗方法原理 胞核提取物可以用于前體 mRNA 的剪接,S100 提取物中雖然包括許多剪接因子,但它不具有剪接活性,因為它只含有剪接所必需的部分 SR 蛋白,不過該提取物中補充一種或多種 SR 蛋白后就可以進行有效的剪接。
    實驗材料

    HeLa 細胞

    試劑、試劑盒

    DTT 苯甲基磺酰氟 PBS 緩沖液

    儀器、耗材

    Eagle 懸浮培養基本培養基 玻璃勾架器 透析袋

    實驗步驟

    ―、材料與設備

    所有的試劑均需用高質量高壓滅菌水配制,例如 Mill Q ( Millipore,Bedford,MA,USA ) 或者雙燕餾水。所有用于培養細胞的成分均需高壓滅菌,不耐熱的材料用 0.22 μm 過濾器過濾除菌。

    1. HeLa 細胞懸浮培養

    (1) 培養基:Joklik 修改后的 Eagle 懸浮培養基本培養基(ICN Pharmaceuticals 公司),或相當的培養基,這種粉末狀的培養基包含除血淸外的所有必須物質。用 Milli Q 水溶解粉末并過濾除菌,配制成 5X 儲備液,用過濾除菌水配制工作液并加入小牛血清至 終濃度為 50 ml/L,pH 約 7.0。

    (2) HeLa 細胞:用適于在懸浮培養基中生長的細胞株,如 S-3 株。

    2. 提取物的制備

    試劑 (1) 和 (2) 儲存液應保存于 -20℃,在使用前再加入溶液 (3)~(6)。

    (1) 1 mol/L DTT。

    (2) 20 mg/ml(115 mmol/L ) 苯甲基磺酰氟(PMSF),溶于乙醇。

    (3) PBS:137 mmol/L NaCl,2.7 mmol/L KCl,8 mmol/L Na2HPO4,1.5 mmol/L KH2PO4,0.5 mmol/L MgCl2

    (4) 緩沖液 A:10 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0),10 mmoI/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,1 mmol/L DTT。

    (5) 緩沖液 B:0.3 mol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),1.4 mol/L KCl,30 mmol/L MgCl2

    (6) 緩沖液 C:20 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),0.6 mol/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,0.2 mmol/L EDTA,25%(V/V)甘油,0.5 mmol/L PMSF,1 mmol/L DTT。

    (7) 緩沖液 D:20 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),100 mmol/L KCl,0.2 mmol/L EDTA,20% ( V/V )甘油,0.5 mmol/L PMSF,1 mmol/L DTT。

    (8) 40 ml Dounce 帶較松研杵的玻璃勾架器。

    (9) 截留分子質量為 12000~14000 Da 的透析袋。

    二、操作方法

    1. HeLa 細胞懸浮培養

    細胞于 37℃ 在轉動培養瓶中培養,細胞密度維持在 2X105~5X105。細胞倍增時間大約是 24 h,細胞密度可用血細胞計數器計數。

    2. HeLa 細胞核提取物的制備

    (1) 取對數生長期(4X105~6X105/ml,不超過 1X106/ml)的 HeLa 細胞用低速離心機在 1800 g 離心 10 min,收集細胞。

    (2) 用冰冷的 PBS 輕輕地重懸細胞,再離心,確定細胞沉淀的體積(PCV )。后面所有的步驟都應該在冰上或者在冷室里進行,所有的離心步驟應該在 4℃ 進行。

    (3) 將細胞沉淀輕輕地重懸在 5 倍 PCV 的緩沖液 A 中,冰上放置 10 min,使細胞在低滲緩沖液中膨脹。

    (4) 于 1800 g 離心 10 min,沉淀細胞。再用 2 倍 PCV 的緩沖液 A 重懸細胞。由于膨脹,細胞沉淀體積會加倍,計算時釆用原來的 PCV。

    (5) 用 Dounce 玻璃勻漿器勻漿大約 10 次。細胞裂解的程度通過臺盼藍染色以血細胞計數器檢測,目標是 90% 的細胞裂解,但勻漿不要超過必需的次數。注意 HeLa 細胞核很大,并不比完整的細胞小多少。

    (6) 裂解液轉入高速離心管中,于 1200 g 離心 10 min,用吸管小心取出上清加入一個量筒中以制備 S100 提取物。

    (7) 在同一離心管中以 33000 g 離心 20 min,小心吸棄上清。

    (8) 12 升 HeLa 細胞培養物獲得的濃縮胞核體積(PNV ) 通常為 9~15 ml。加 2 ml 緩沖液 C,旋動以使沉淀與離心管分離,但是不要使沉淀散開,將沉淀和液體轉移到帶刻度的一次性試管,測量體積,然后減去 2 ml 為估計的 PNV,加入更多緩沖液 C ( 含 0.6 mol/L KCl ) 使 KCl 的終濃度為 0.24 mol/L,其范圍應該為 0.20~0.25 mol/L。

    (9) 將沉淀和緩沖液(還不要將沉淀重懸,否則溶液將變得黏稠且很難沒有損失地轉移 ) 轉移到一個干凈的 40 ml 玻璃 Bounce 勻漿器中,用一個較松的研杵勻漿幾次使之懸浮。勻漿 10 次應該足以制備勻質的懸液。

    (10) 將勻漿轉移到一個或多個帶螺帽的高速離心試管中并輕輕晃動混合 30~45 min。

    (11) 高速離心(約 33000 g,30 min)沉淀鹽洗過的細胞核,并小心地將上清轉移到一次性試管中,避免沉淀的污染。

    (12) 用緩沖液 D 透析上淸兩次(通常用 1~2 L)。一次過夜,另一次至少 4 h。

    (13) 33000 g 高速離心 20 min,去除透析過程中形成的沉淀,并小心地將上清(核提取物)轉移到一次性試管中。

    (14) 將提取物以 0.1~1 ml 分裝到微量離心管中。將離心管放入液氮中快速冷凍,于 -70°C 或更低溫度儲存。

    3. HeLa 細胞胞質 S100 提取物的制備

    在等待操作1 "HeLa 細胞核提取物的制備" 中的步驟 (7) 的離心時,將第 (6) 步得到的上清進步處理可獲得 S100 提取物,它包括胞質成分和許多(但非全部)核成分,它在低滲緩沖溶液 A 中提取。

    (1) 測量上請液的體積,加 0.11 倍體積的緩沖液 B,輕輕混合。

    (2) 在超速離心管中以 100000 g 離心 1 h。

    (3) 將上清轉入一次性試管中。

    (4) 用緩沖液 D 透析 2 次,一次過夜,另一次至少 4 h。提取物的體積在透析期間顯著縮小,這是因為緩沖液 D 中含有的甘油使提取物濃縮。

    (5) 33000 g 高速離心 20 min 去除不溶物質。

    (6) 將提取物以 0.1~1 ml 分裝到微量離心管中,快速冷凍并如操作3 “HeLa 細胞核提取物的制備” 中的步驟 (14) 所述儲存。12 升培養物可制備胞質 S100 提取物 40~55 ml,總蛋白濃度為 10~15 mg/ml 提取物活性可保持數年之久。

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