用于檢測V．p的PCR方法主要有任意引物PCR(abritrarilyprimedPCR，Ap-PCR)、針對任意引物PCR、多重PCR(muhiplex-PCR)、實時PCR(Real-timePCR)。
1、任意引物PCRMatsumoto等采用任意引物PCR對V．p進行檢測。他們針對V。p的tdh基因和trh基因一段特異的序列，設計兩條引物，
引物1：5--GGTGCGGGAA--3，
引物2：5一GTTTCGCTCC一3，
對1977～1998年所收集的227株V．p進行PCR。通過電泳分析發現，1996-1998年收集的22株血清型為03：K6菌株與1996年以前收集的03：K6血清型菌株基因序列有所不同，為03；K6血清型新出現的變異株，并最初出現在孟加拉國。這是目前最簡單的以基因為基礎的細菌亞分型方法。
2、針對任意引物PCR由于臨床分離株絕大多數含有tdh基因，因此絕大部分研究者都根據tdh設計引物進行特異擴增。1993年，Lee等根據tdh基因設計引物，對36株TDH+株、89株TDH-株以及46株其他弧菌和腸道菌進行PCR檢測。結果顯示，36株TDH+株全部特異擴增出來，其余菌株都沒有擴增；而檢測靈敏度高，最低檢測量可至40pgDNA，并可直接檢測糞便標本，無需分離培養，方便快速。1999年，Kim等選擇toxR基因序列設計兩對引物，5’--GTCTTCTGACGCAATCGTTG--3和5’一ATACGAGTGGTTGCTGTCATG一3’，對14株V．p、14株其他弧菌進行PCR。結果顯示，14株V．p都得到一條368bp的特異擴增亮帶，而其他菌株沒有特異擴增。此外，Venkateswaran等選擇gyrB基因設計引物對V·p進行PCR、Cordova等選擇pR72H基因設計引物進行PCR，特異性、靈敏度都很好。
3、多重PCR由于不是全部副溶血性弧菌都含；tdh基因或，trh。基因，所以只針對tdh或trh的單一PCR，有時會漏檢。多重PCR(multiplex-PCR)能全方位高效率地檢測Vpo1994年，Bej白等針對“、tdh、trh設計不同的引物對，在同一PCR反應體系內同時擴增tl、tdh、trh。結果顯示，所有的V。p都擴增出“基因，tl基因是V．p特異的；54%的V．p擴增出tdh基因；只有38．73%的V．p擴增出trh基因；該法靈敏度高，能把log牡蠣培養肉湯里10～100個V．p檢測出來。與其他常規生化方法相比，多重PCR更快速，僅8h就能完成檢測，結果更為準確、可靠，而且還可改進成定量競爭PCR，對標本中靶序列進行定量。
4、實時PCR常規PCR檢測，需要從反應體系中吸取產物做電泳或Southern雜交等試驗進行鑒定，轉移過程中易污染，造成假陽性，而且耗費時間。1996年，Tyagi開創了一種實時PCR(Real-timePCP,)。實時PCR是在，PCR反應體系中加入標記有報告基團和淬滅基團的線性Taqman。探針或莖環型熒光分子信標探針，在墓因擴增過程中，與產物雜交，此時，報告基團和淬滅基團分開，根據能量共振轉移現象，報告基團發出熒光而被檢測。這種方法操作簡單，閉管檢測，減少污染，靈敏度高，并且可以在PCR結束或PCR過程進行同步定性或定量檢測，面且可以進行臨床大規模快速檢測。