先天性動眼神經麻痹：此型較少見，絕大多數為單眼，其原因為發育異常或產傷所致。
后天性動眼神經麻痹：后天性動眼神經麻痹雖較先天性動眼神經麻痹為多見，但在與眼球運動有關的三對腦神經中，它是較少發生的。臨床上動眼神經的分支麻痹較動眼神經麻痹多見。動眼神經上支麻痹較下支麻痹為多見。具體病因包括：
一、腦干病變
1、Benedikt綜合征，表現為同側動眼神經麻痹和對側意向性震顫
2、 Weber綜合征，表現為同側動眼神經麻痹和對側偏癱
二、炎癥環境
1、腦膜炎
2、腦炎
3、由酒精、鉛、砷和一氧化碳中毒或者由糖尿病導致的多發性神經炎
4、帶狀皰疹病毒感染
5、埃可病毒感染
三、血管病變
1、微動脈瘤
2、頸內動脈(ICA) 剝離, ICA狹窄
3、頸動脈海綿狀瘺