包涵體性結膜炎是沙眼衣原體中D-K抗原型衣原體所致的結膜炎。此型衣原體能引起子宮頸炎及尿道炎。眼部感染來自生殖泌尿系統。常侵及雙眼，為急性發病。包涵體性結膜炎是一種通過性接觸或產道傳播的急性或亞急性濾泡性結膜炎。多為雙側。由于表現有所不同，臨床上又分為新生兒和成年人包涵體性結膜炎。
本病是由沙眼衣原體（血清型D至K）引起的一種急性結膜炎，在新生兒稱為新生兒包涵體性結膜炎，在成人稱為成人包涵體性結膜炎。
新生兒包涵體性結膜炎是新生兒通過被感染的產道所致。大多數成人包涵體性結膜炎是接觸感染的生殖器分泌物所致。