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  • 發布時間:2017-11-03 10:04 原文鏈接: 北京基因組所資源建設取得階段性進展

      近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊以Database Resources of the BIG Data Center in 2018為題的研究論文,在線發表Nucleic Acids Research上。這是繼去年首次在該期刊發布我國生命組學數據資源建設成果The BIG Data Center: from deposition to integration to translation后又一階段性重要進展,標志著我國建設綜合型生物信息資源庫進一步獲得國際同行認可。

      北京基因組所生命與健康大數據中心面向國家大數據發展戰略,承擔著建成多層次生物組學數據資源系統,建設組學大數據匯交共享平臺,并建立多組學生物大數據資源體系的重要任務。北京基因組所生命與健康大數據中心在原有多組學資源庫基礎上,添加建立了四個新庫,包括生物信息工具代碼庫(Biological Tool Codes,BioCode)、生物項目數據庫(Biological Project Library,BioProject)、生物樣本數據庫(Biological Sample Library,BioSample)、內參基因知識庫(Internal Control Genes,ICG)。同時,更新了原有的多個數據庫,包括原始測序數據歸檔庫(Genome Sequence Archive,GSA)、基因表達數據庫(Gene Expression Nebulas,GEN)、基因組變異數據庫(Genome Variation Map,GVM)、表觀基因組數據庫(Methylation Bank,MethBank)、生命科學維基知識庫(Science Wikis)。此外,推出了三個特色網絡服務,跨庫檢索服務BIG Search、統一認證與單點登錄服務BIG SSO、生物數據提交服務Gsub。其中,BIG Search可對大數據中心內部數據庫進行多庫檢索,并實現了多單位的跨庫檢索,包括北京大學(LncRNADisease)、天津大學(DoriC,DEG)、華中科技大學(AnimalTFDB,dbPAF,lncRNASNP,PLMD)的多個重要數據庫。

      研究工作得到中科院戰略性先導科技專項、中科院國際大科學計劃、國家高技術研究發展計劃(863計劃)、國家重點基礎研究發展計劃(973計劃)、國家自然科學基金、中科院百人計劃等的資助。

    生命與健康大數據中心核心數據資源

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