生物潔凈安全柜是當今微生物實驗室之必要品，特別是那些對操作者需要采取保護措施的場合。如醫療、制藥、科研等進行細菌培養時提供既無菌無塵又工作安全的環境。
合理定期的維護對維護任何設備的正常工作都是至關重要地，這一點對生物安全柜也不例外。按照下面推薦的維護日程表對安全柜進行維護，保持其性能。
一．每日維護
用70%的酒精（其他殺菌劑視用戶使用的材料而定）徹底對安全柜內部工作區域表面、側壁、后壁、窗戶進行表面凈化。不要用含有氯的殺菌劑，因為它可能對安全柜的不銹鋼結構造成損壞。也要對紫外燈和電源輸出口表面進行清潔。當清潔安全柜內部區域時，操作人員除了手放以外，身體的其他任何部位不能進入安全柜。
二．每周維護
1.檢查俘獲紙孔處的殘留物質
2.用70%的酒精（其他殺菌劑視使用的材料而定）徹底對排水槽進行清洗
三．每月維護
1.用濕布對安全柜外部表面進行擦拭，尤其是安全柜的前面和上部，把堆積的灰塵打掃干凈。
2.檢查所有的維護配件的合理使用情況。
3.上述每日工作中的條目
四．每季維護
1.檢查安全柜的任何物理異常或故障。檢查熒光顯像管確保它們工作正常
2.當不銹鋼上表面有難以去除的斑點時，可以使用MEK（methyl-ethyl-ketone）。使用WEK后，快速用清水和液體清潔劑沖洗不銹鋼板，并且用聚亞安酯布或者海綿進行擦拭。定期清潔不銹鋼表面會使之保持表面的光滑美觀。
五．每年維護
1.具備資格的認證技術人員對安全柜進行性能認證。
2.更換紫外燈