十二指腸潰瘍的典型臨床表現有上腹痛及上腹不適等，絕大部分人可出現各種消化不良的癥狀，但是有的也無任何癥狀，直至出現并發癥。其常見的并發癥主要有出血、穿孔。常見的胃腸道癥狀及全身癥狀主要有噯氣、反酸、上腹脹、胸骨后燒灼感、惡心、嘔吐、納差等。反酸及胸骨后燒灼感是由于賁門松弛，惡心、嘔吐多反映潰瘍可能提示潰瘍處于活動期。部分患者有失眠、多汗等植物神經功能紊亂癥狀。
