典型的潰瘍底部活動期常分為四層：第一層急性炎性滲出物，由壞死的細胞、組織碎片和纖維蛋白樣物質組成；第二層為以中性粒細胞為主的非特異性細胞浸潤所組成；第三層為肉芽組織層，含有增生的毛細血管、炎癥細胞和結締組織的各種成分；第四層為纖維樣或瘢痕組織層，可擴張到肌層，甚至達漿膜層。由于內鏡下活檢取材只能達黏膜層或黏膜下層，通常不能觀察到典型的潰瘍的四層結構，其病理組織上主要表現為黏膜層炎癥細胞侵潤，固有膜內有以淋巴細胞和中性粒細胞為主的
