千種熱帶植物基因組計劃啟動

　　近日，第一屆國際熱帶植物學術會議在海南三亞舉行。會上啟動的海南大學—貝納基因等千種熱帶植物基因組計劃與熱帶作物基因組與分子育種數據庫聯合平臺計劃，將進一步加強熱帶海量植物資源保護與利用基礎研究，服務海南熱帶高效農業發展，同時為熱帶雨林植物數字化管理提供理論依據及全新方法。

　　據介紹，我國和全球熱帶植物物種遺傳資源極為豐富，其經濟價值和生態價值巨大。而全球性熱帶經濟植物的基礎研究落后，除了少數熱帶經濟作物完成基因組測序，絕大多數具有極高遺傳多樣性的熱帶雨林植物、珍稀瀕危植物的基因組知識知之甚少，而這些基礎數據的獲取不僅是開展遺傳改良所必需，同時也是進化分類關系重建，遺傳多樣性定量評估，制定合理保護策略的基礎。

　　另一方面是第三代基因組測序技術的長足進步，使得一般基因組測序與組裝能力大大提升，成本顯著減低。通過海南大學與貝納基因的長期合作，制定最佳的基因組測序—組裝作業策略，能夠快速、高效完成大量基因組測序和數據處理工作，陸續發表高質量基因組，淀積數據，支持遺傳改良和大尺度生物演化的研究。

　　在海南大學—貝納基因等千種熱帶植物基因組計劃中，校企合作將完成1000種熱帶特色經濟植物基因組測序注釋，涵蓋熱帶特有植物、珍稀瀕危植物、熱帶特色水果、蔬菜、藥用植物、觀賞植物、油料、經濟林木和具有特殊生態價值物種；創建千種熱帶植物基因組及遺傳多樣性數據庫；結合圖像信息，構建海南熱帶雨林國家公園數字化管理系統等。

　　在分子育種數據庫聯合平臺計劃中，海南大學與中國科學院北京基因組研究所將聯合創建熱帶作物基因組及分子育種大數據平臺，服務全球熱帶作物基礎研究和遺傳改良。

　　海南大學負責提供熱帶作物基因組序列、物種群體重測序、轉錄組、蛋白組、代謝組及表型數據信息；組織團隊負責持續的數據加載、軟件開發，完善針對主要熱帶作物的全基因組基因檢索、基因共表達網絡、多基因性狀位點及全基因組標記，GS育種設計等高級功能。

　　中國科學院北京基因組研究所提供基因組前沿技術支撐，提供數據庫結構模塊、數據存儲和交換物理空間，數據訪問的流量通道。部分開放遠程后臺，供海南大學加載數據和軟件，提供相關技術人員培訓空間及條件。

　　雙方聯合未來將創建全球最具有代表性的熱帶作物基因組和分子育種大數據服務平臺。以該平臺為基礎，逐步擴大發展成為國家基因組科學數據中心熱帶作物基因組學分中心。