華大智造DNBSEQG99助力入侵中國猴痘病例病毒溯源

目前，在中非和西非以外的多個非流行國家發現了許多猴痘病例，并且頻繁發生人傳人。世界衛生組織已于7月23日宣布猴痘為國際關注的突發公共衛生事件（PHEIC）。被忽視的人畜共患病猴痘再次成為全球關注的焦點，中國為防止猴痘病毒輸入和傳播敲響了警鐘并于2022年7月1日發布了中國猴痘防治技術指南，實現早發現、早報告、早隔離、早治療，進一步加強對來自流行區的旅客和移民進行癥狀監測，控制猴痘病毒人傳人。

9月19日，《中國疾病預防控制中心周報（China CDC Weekly）》公布中國內地首例輸入性猴痘病例相關信息：一名中國籍男子在9月14日回國，被重慶市疾控中心確定為猴痘疑似病例。該男子此前曾出現喉嚨干燥發癢，發燒，右腳踝出現紅色皮疹和膿皰等癥狀。

9月16日，采集的該男子的臨床樣本被送往中國疾病預防控制中心，進行了qPCR檢測，并基于華大智造最新款基因測序儀DNBSEQ-G99等設備完成了全基因組測序。基因測序結果表明，該男子所感染的猴痘病毒(China-CQ202209) 屬于西非株的B.1分枝，和重慶疾控中心測序結果高度一致，并且與2022年6月21號在德國發現的毒株 (GISAID ID: EPI_ISL_13889435)高度同源。這些結果確認了該病例為中國內地首例輸入性猴痘病例，同時也是中國報道的第5例人感染猴痘病毒病例。其他幾例輸入性人感染猴痘病毒的病例分別報道于中國臺灣和中國香港特別行政區。

值得一提的是，華大智造基于全新技術打造的最新款基因測序儀DNBSEQ-G99，助力此次溯源測序在短時間內得到了高度可信的毒株序列全長。面對qPCR檢測Ct值為21左右的樣本時，三種不同讀長宏基因組測序統計猴痘病毒特異性reads平均約占0.35%。分析結果顯示在讀長為SE40時，猴痘病毒基因組平均深度約為35X；SE100時，其平均深度約為110X；PE100時，其平均深度約為200X，100X以上覆蓋度大于99.03%。

DNBSEQ-G99通過高密度三角形矩陣的載片、秒級極速的生化反應、緊密排布的流體系統、超高分辨率光學系統、比PCR儀快2倍的溫控系統等多個核心系統的集成，實現了對測序效率、質量和交付能力的極致提升。同時，DNBSEQ-G99的多時點數據輸出模式（bioanalysis by sequencing, BBS)，可進一步縮短交付時間，最快在測序開始后的2.5小時內獲得第一批下機數據，在極致快速的基礎上更快一步，且測序讀長不受限，更加適用于公衛系統緊急多元的檢測場景。此次猴痘病毒溯源采用的正是DNBSEQ-G99的BBS模式，在實驗全流程第9小時獲得第一批下機結果，助力疾控系統應急溯源能力進一步提升，更高效地為快速制定相應防疫政策提供科學依據。

針對新發未知病原體的快速識別和溯源需求，華大智造基于自主研發的試劑、儀器和軟件打造了病原微生物高通量測序產品組合，覆蓋從樣本到報告輸出全流程，是猴痘病毒識別和溯源的理想工具。該產品組合可兼容DNBSEQ-G99、DNBSEQ-E25、MGISEQ-200和MGISEQ-2000四款測序儀, 文庫制備與數據分析均實現了自動化操作。華大智造獨有的DNBSEQ技術，為病原體的識別和溯源保障高質量的測序數據。

作為全球少數能自主研發和量產臨床級測序儀的高端制造商之一，華大智造的基因測序儀、實驗室自動化設備、實驗室管理系統等生命科技核心工具已馳援全球80余個國家和地區的抗擊新冠疫情防控一線，全面助力各地疫情防控和病毒溯源，為應對突發疫情提供強有力的工具支撐。針對突發的猴痘疫情，華大智造DNBSEQ-G99可助力在11.5-16小時*內完成猴痘病毒樣本的文庫制備、測序和組裝分析全流程。為進一步提升猴痘病毒溯源的準確性，華大智造針對猴痘病毒基于ATOPlex平臺定制化設計多重PCR panel（ATOPlex MPXV）正在適配更多的毒株，用于猴痘病毒的快速鑒定和溯源。

秉承“創新智造引領生命科技”的理念，在公共衛生應用領域，華大智造將持續致力于滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程等應用場景的需求，為公共衛生事件的監測和預警提供更自動、更便捷、更高效的國產化核心工具。