將制備好的單細胞懸浮液，按照一定的細胞密度，接種于適當厚度的薄層固體培養基上進行培養的方法，稱為平板培養。
等量的單細胞培養液與等量熔化(30～50℃)的瓊脂培養基(0．6%～1%)混合，迅速鋪板于培養皿中，瓊脂冷卻凝固后，細胞分布均勻地被固定在薄層(厚度大約1mm)培養基中。培養皿用石蠟膜封閉，在25℃黑暗或漫射光照射下培養。
培養皿可以在倒置顯微鏡下觀察，用優質記號筆在培養皿外側標記單細胞的位置，以便 跟蹤觀察這些細胞的生長和再生，確保篩選出純的單細胞無性系。
