實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外，還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選，而且 DNA 文庫具有更好的穩定性，操作也相對簡便。
實驗材料 3' 引物鏈親和素磁珠
儀器、耗材 電泳儀PCR 儀離心機凝膠成像儀液體閃爍儀長波紫外燈紫外分光光度計核酸定暈儀pH計培養箱振蕩器潔凈工作臺
實驗步驟
一、材料與設備
1. 5' '端標記有生物素的 3' 引物。
2. 鏈親和素磁珠（Promega 公司）。
其他設備與試劑與 RNA 文庫方案一致。
二、操作方法
1. 不對稱 PCR 制備 ssDNA
(1) 首先將篩選獲得的 ssDNA 參照 RNA 文庫的實驗方案擴增成雙鏈 DNA，純化回收。
(2) 確定不對稱 PCR 制備 ssDNA 文庫所需的最佳雙鏈 DNA 模板量。取不同量的上述 PCR 產物為模板，不對稱 PCR 擴增 35 個循環。
不對稱 PCR 反應體系如下：10X PCR 反應緩沖液 10 μl，dNTP 混合液 8 μl，5' 引物（25 pmol/μl ) 2 μl，3' 引物（1 pmol/μl ) 0.5 μl，dsDNA 模板 不定，Taq DNA 聚合酶（2 U/μl ) 1 μl，加去離子水補齊至 100 μl。
PCR 反應條件：95℃ 預變性 5 min；94℃ 變性 30 s，55℃ 退火 30 s，72 ℃ 延伸 30s，擴增 35 個循環；最后 72°C 終延伸 5 min。
含 7 mol/L 尿素的 12% 變性 PAGE 觀察，單鏈 DNA 條帶應比雙鏈 DNA 的條帶略為偏上，挑選出能產生大量且條帶清晰的單鏈 DNA 的雙鏈 DNA 模板最作為最佳量。
(3) 取最佳雙鏈 DNA 模板量進行大量不對稱 PCR 擴增，含 7mol/L 尿素的 12% 變性 PAGE 切膠純化，然后用核酸定量儀確定 ssDNA 的量用于下一輪篩選。
(4) 在第一輪篩選中，投入的 ssDNA 是直接合成的。
2. 鏈親和素磁珠制備 ssDNA
(1) 用 5' 端標記有生物素的 3' 引物將篩選獲得的 ssDNA 擴增成雙鏈 DNA，純化回收，用 SHMCK 緩沖液溶解至 20 μl。
(2) 鏈親和素磁珠的準備。取 0.5 ml 鏈親和素磁珠用 0.5X SSC 洗三遍，每次 600 μl，每次 1 min，再用 SHMCK 緩沖液洗三遍，每次 600 μl，每次 1 min。
(3) 將雙鏈 DNA 與磁珠混合，再加入 40 μl SHMCK 緩沖液，室溫孵育 30 min（在 DNA 混合器上使之充分混合）。
(4) 磁鐵吸附后棄上清，用 SHMCK 緩沖液洗三遍，每次 600 μl，每次 1 min。
(5) 加入 0.15 mol/L NaOH 400 μl，將雙鏈 DNA 裂解為 ssDNA，于 37℃ 孵育 15 min。
(6) 磁鐵吸附后吸出上清，并加入 20 μl 3mol/L HCl 中和其中的 NaOH，調整其中的緩沖體系為1X SHMCK，0.1% 明膠，12 μg/μL tRNA，總體積為 500 μl，進入下一輪篩選。