1.癌抗原125（CA125）測定
CA125是一種存在于胚胎體腔上皮副中腎導管衍生物及其贅生物組織中的一種高分子糖蛋白，能與單克隆抗體OC-125發生特異性結合，作為一種腫瘤相關抗原，對卵巢上皮性癌有一定的診斷價值。但在子宮內膜異位癥患者，CA125值可升高，且隨內膜異位癥期別的增加，陽性率也上升，其敏感性和特異性都較高。
2.抗子宮內膜抗體（EMAb）
EMAb是一種以子宮內膜為靶抗原，并引起一系列免疫病理反應的自身抗體，是子宮內膜異位癥的標志抗體。血清EMAb的檢測為子宮內膜異位癥患者的診斷及療效觀察的有效檢查方法。
3.B型超聲檢查
可見附件區與子宮密切相連處有輪廓不規則囊腔，液性暗區中充滿彌漫性雜亂細回聲，或不均勻的片狀回聲，或直腸子宮陷凹有液性暗區。
4.陰道后穹隆穿刺抽出咖啡色或巧克力色渾濁液，甚至有血性液體。
5.MRI檢查
MRI的表現多變，根據所用脈沖序列不同及病灶內成分的不同而異。完全出血性病灶在T1、T2加權圖像上為均一密度的高信號，T2加權圖像上信號升高。
6.腹腔鏡檢查
為診斷子宮內膜異位癥的最佳方法，是借助腹腔鏡直接窺視盆腔，見到異位病灶或對可見之病灶進行活檢確定診斷，并可根據鏡檢的情況決定盆腔子宮內膜異位癥的臨床分期及確定治療方案。