1.實驗室檢查
（1）糞便檢查：①糞便酸堿度檢查：正常呈中性，弱酸性或弱堿性，本病患者通常呈酸性（pH 5～6）；②糞便還原糖測定：正常為陰性，本病患者呈陽性，通常≥5g/L。
（2）乳糖耐量試驗：血糖曲線低平，說明存在乳糖不耐受。
（3）氫呼氣試驗：基礎值＜20ppm，當超過20ppm時，說明存在乳糖酶缺乏。
2.影像學檢查
腹部X線檢查：未發現器質性病變，有助于排除消化道其他疾病。
3.病理檢查
小腸黏膜活檢測定乳糖酶活性：是直接測定乳糖酶活性的金標準，缺點是活檢對受試者具有創傷性，且乳糖酶在小腸黏膜分布不均勻，需取多個部位進行檢測。本病患者乳糖酶活力測定結果明顯低下。
