原生動物的接合生殖多見于纖毛蟲類，按接合的雙方，即接合子的形態又可分為兩類：
①同配接合：接合子的形態相同。接合時雙方暫時融合，小核在減數分裂后進行交換，相互受精后分開，如尾草履蟲。
接合雙方緊靠在一起，口部融合，然后大核消失小核分裂二次，成4個，其中3個退化，一個再經一次分裂成為一個動核和一個靜核。此時接合個體互相交換動核，然后靜核與換來的動核融合。接著蟲體分開，每個個體的融合核分裂三次形成8個核，其中4個成大核，3個退化。此后大核不分裂，剩下的小核與蟲體同時分裂兩次而成為4個新的子體。
②異配接合：見于緣毛目類纖毛蟲。在進行接合生殖前，蟲體先經一次不均等分裂，除小核外大核和蟲體都分成大小兩部分，成為大接合子和小接合子，前者固著，后者自由游泳。小接合子找到大接合子后即牢固附著在其上開始接合。在接合過程中，合子核只在大接合子中形成，小接合子為大接合子吸收。如鐘蟲。