原腸胚的特點是：具有原腸腔和外、中、內三個胚層。原腸胚的外胚層由包被胚胎表面的動物極一端的細胞構成，內胚層由陷入囊胚腔的細胞構成，中胚層位于內、外胚層之間，這三個胚層繼續發育，經過組織分化、器官形成，最后形成一個完整的幼體。
外胚層：形成神經系統的各個器官，包括腦、脊髓和神經、眼的網膜、虹膜上皮、內耳上皮、以及皮膚的表皮和皮膚的附屬結構。
內胚層：形成消化道（咽、食道、胃、腸等）和呼吸道（喉、氣管、支氣管等）的上皮，肺、肝、胰和咽部分衍生的腺體（甲狀腺，副甲狀腺、胸腺等）以及泌尿系統的膀胱、尿道和附屬腺體的上皮等。
中胚層：主要形成各種肌肉、骨胳、結締組織以及皮膚的真皮，循環系統（心臟、血管和血液）、排泄系統（腎、輸尿管）、生殖系統（生殖腺、生殖管道及附腺等）、氣管和消化道的管壁、體腔膜等。
細胞分化在胚胎期達到最大限度。