增加心血管類疾病的發病率
研究顯示反式脂肪含量高的飲食和諸如心臟動脈疾病以及動脈硬化等疾病有關聯性。研究顯示如果每天攝入反式脂肪5克，心臟病的發病幾率會增加25%。而在美國均每人每年的攝入量是2.1公斤。一些國家已經立法限制食物里反式脂肪的含量與使用。
漢堡包、薯條和外賣爆米花中就含有大量的反式脂肪。它會導致膽固醇增高以及冠心病。
或可降低男性精子密度
哈佛大學公共衛生學院一項最新的研究顯示，攝入大量的反式脂肪可能會降低男性的精子密度（精子密度是評價男性生育能力的一項指標）。
相關研究數據采自33名男性，該研究再次證明了反式脂肪對健康構成的負面效應，之前有研究表明，反式脂肪會增加心血管疾病的風險。
由喬治.查瓦羅領導的研究團隊表示，在男性精液中發現了反式脂肪酸，并且反式脂肪酸的含量跟精子密度呈現負相關性。
研究人員還表示，此次研究結果同小白鼠實驗結果相吻合，之前的小白鼠實驗顯示，反式脂肪酸會顯著地影響精子的生成。
然而研究人員對此次研究的結果仍持謹慎態度，他們表示，該實驗具有局限性，有必要擴大試驗規模，設計更為完善的試驗，同時密切關注反式脂肪與精子密度的關系。
對胎兒的危害
如果準媽媽或是正處于哺乳期的女性攝入過多的反式脂肪，當母體內的反式脂肪酸占總脂肪的一定量時，準媽媽體內的反式脂肪可能會通過胎盤轉運給胎兒，而正吃母乳的嬰幼兒則會因為母親攝入反式脂肪，也會被動地攝入反式脂肪，這樣一來，胎兒和新生兒就可能會患上必需脂肪缺乏癥。另外，如果育齡婦女過多食用含反式脂肪的食品，可能還會面臨不孕的風險 。