發芽箱的作用是提供種子發芽所需溫度、濕度或水分、光照等條件，或者具有自動變溫的功能。因此，對發芽箱的基本要求是保溫良好，光照滿足，通氣良好，調節簡便，控制準確，箱內不同部位溫差小。
1．電熱恒溫發芽箱
這是一類目前使用最普遍的發芽箱。這類發芽箱的構造主要由保溫、加熱和控溫等部分組成。這是所有發芽箱都須具備的基本結構。保溫部分即為箱身，目前多用具有隔熱材料的夾層金屬皮構成；加熱部分多為電熱絲；溫度控制部分目前多采用電接點水銀導電表一繼電器進行溫度自動調控。此類發芽箱的使用十分方便。只要旋轉磁性螺帽，將溫度計中的溫度指示塊調節到發芽所需溫度即可。
2．變溫發芽箱
目前我國已開發幾種變溫發芽箱。它們都有一個保溫良好的箱身。箱的下部設有加熱系統，箱的上部設有制冷系統。根據發芽技術要求，可以升溫、降溫或變溫。箱身后部裝有鼓風機，使箱溫保持一致。箱內中間配有數層發芽網架，在箱的內壁裝有日光燈，供給發芽的光照。其特點是采用微電腦可自動調節和控制所需變溫和光照條件。可控制變溫的時間和溫度轉換，即在高溫(如30℃)時段保持8h，低溫(20℃)時段保持16h。高溫和低溫可根據發芽溫度在開始時調節好。當不需用變溫時，也可采用單路控制，以保持恒溫。該箱控制溫度范圍為5～50℃，是一種功能較為完備的發芽箱。
3．光照發芽箱
這種發芽箱具有加溫、供水和光照多種功能。如我國生產的光照發芽箱，其基本結構與國際通用的發芽裝置相同。箱身為一個恒溫水槽，其上配有玻璃蓋用以保溫保濕，在水槽中下部裝有一套浸入式電力加熱器。恒溫控制由水銀溫度導電表和繼電器來完成。水槽上面設有一塊開有32個圓孔的金屬板。每一孔上可放發芽器。
4．人工氣候箱
目前我國已設計和生產有幾種類型的人工氣候箱。這種類型的氣候箱，裝備有致冷加熱、加濕、光照和風扇等系統，采用微電腦控制技術，具有自動快速變溫，變光和調濕功能，能完全滿足各種作物種子發芽所需的條件，可按種子發芽技術規定，任意設置，并具有自動時差糾正，超欠溫報警和延遲啟動保護等功能。這是一類較先進的種子發芽箱。
5．發芽室
目前我國已在多個省市種子檢驗室中裝備了智能人工氣候室。墻壁和天花板裝上保溫隔材料，室內裝有冷暖風機、除濕機通風換氣扇、臭氧發生器、紫外消毒燈等設備，并裝備有自動加濕、控溫、自動進水系統的種子發芽車。采用微電腦控制技術，具有自動控溫、變溫、控光、變光，時間程序任意設備、自動時差糾正、超欠溫報警、啟動延時保護、過載過流、缺相斷電保護等功能。并且室內也具有除濕通風、照明，臭氧和紫外清毒等功能。特別是室內配置的發芽車，采用獨立的超聲波加濕器，能按種子發芽的需要，調節控制適宜的濕度，更適合紙巾卷和開口容器的發芽和幼苗培育。