同工酶(isozyme，isoenzyme)廣義是指生物體內催化相同反應而分子結構不同的酶。按照國際生化聯合會(IUB)所屬生化命名委員會的建議，則只把其中因編碼基因不同而產生的多種分子結構的酶稱為同工酶。最典型的同工酶是乳酸脫氫酶(LDH)同工酶。
同工酶的基因先轉錄成同工酶的信使核糖核酸，后者再轉譯產生組成同工酶的肽鏈，不同的肽鏈可以不聚合的單體形式存在，也可聚合成純聚體或雜交體，從而形成同一種酶的不同結構形式。同工酶是指催化相同的化學反應，但其蛋白質分子結構、理化性質和免疫性能等方面都存在明顯差異的一組酶。