中科院上海生科院生物化學與細胞生物學研究所國家蛋白質科學中心(上海)吳立剛研究組與上海市計劃生育研究所施惠娟研究組合作,優化建立了適用于微量樣本的小RNA深度測序文庫構建方法,并系統解析了小鼠早期胚胎發育過程中小RNA的動態變化及其生物學功能。相關研究成果日前在線發表于《科學進展》。
目前小RNA深度測序的文庫構建通常要幾百納克總RNA,研究配子和胚胎等難以大量獲取的生物學樣品中的小RNA表達譜較為困難。研究人員通過優化基于連接反應的小RNA文庫構建方法,使得總RNA用量降為幾十分之一,僅需要10納克總RNA即可實現對小RNA的深度測序,為研究配子、胚胎和各種干細胞中的小RNA提供了重要技術支撐。
研究人員還利用優化的方法系統,不僅揭示了小鼠早期胚胎發育中miRNA的表達和降解規律,還發現了miRNA對靶基因的調控活性隨著胚胎發育而被動態調控的現象,對于理解miRNA在早期胚胎發育中的功能和機制具有重要意義。
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