1、口服可引起胃腸道反應：惡心、嘔吐、上腹部不適、腹脹、腹瀉等。
2、可使體內正常菌群失調，引起維生素缺乏、真菌繁殖，出現口干、咽痛、口角炎、舌炎、舌苔色暗。引起消化道、呼吸道或尿路的二重感染，嚴重者發生敗血癥。
3、較大劑量靜脈給藥或長期口服可引起肝臟損害，加重氮質血癥。
4、四環素牙：孕期服用四環素后，分娩的小兒或兒童服用四環素后，牙齒產生不同程度的黃染、牙釉質發育不良、齲齒，并可致骨發育不良。
5、過敏反應：可引起藥物熱、各種皮疹，也可誘發光敏性皮炎。偶見發生過敏性休克、哮喘、紫癜等。
6、靜脈用藥時可產生局部疼痛，甚至發生血栓性靜脈炎。
7、服用變質四環素可引起范可尼綜合征，產生腎小管性酸中毒。