緩步動物(tardigrade),更常見的俗名是“水熊蟲”,因為它看起來像可愛的多腿小熊。這種微小的動物對幾乎所有的東西都有抵抗力:煮,凍,輻射,丟真空——它都很難死掉,可以說是地球上最強悍的生物之一。因此,生物學界對水熊蟲不僅嘆為觀止,而且視之為研究瑰寶,期望它會帶來可與果蠅相比擬的貢獻。
最近,來自北卡羅來納大學教堂山分校(UNC)的研究人員,對這種幾乎堅不可摧的緩步動物進行了基因組測序,并發現了一些他們意想不到的事情:它們基因組的一大部分——近六分之一或百分之17.5,是來自于外源DNA。
本文共同作者、UNC藝術與科學學院生物系教師BobGoldstein指出:“我們并不知道,一個動物的基因組,是由這么多的外源DNA組成。我們知道,許多動物都獲得了外源基因,但我們不知道,它會發生到如此程度。”
這項工作,發表在十一月二十三日的《PNAS》,不僅提出了“外源基因和水熊蟲在極端環境中的生存能力之間是否存在關聯?”的問題,而且進一步延伸了“DNA是如何遺傳的”的傳統觀念。
本文第一作者ThomasBoothby和Goldstein及其同事們發現,水熊蟲獲得的約6000個外源基因來自于細菌,但也來自于植物、真菌和細菌,通過一個被稱為水平基因轉移(horizontalgenetransfer)的過程——遺傳物質在物種之間交換,而不是僅從親本那里遺傳DNA。之前另一個微觀動物(稱為輪蟲rotifer)是具有最多外源DNA的記錄保持者,但其具有的外源DNA只是水熊蟲的大約一半。相比之下,大多數動物的基因組中,只有百分之一的基因組來自于外源基因。
Goldstein實驗室博士后Boothby稱:“可以生存在極端壓力條件下的動物,可能特別容易獲得外源基因——細菌的基因可能比動物更能承受壓力。”畢竟,細菌在地球上最極端的環境中已經生存了數十億年。
研究小組推測,DNA是隨機地進入基因組,但是保留下來的基因,讓水熊蟲能夠生存在惡劣的環境中,例如,把水熊蟲放在零下80攝氏度冰箱一年,甚至十年后,在解凍后20分鐘它又開始四處活動。
Boothby和Goldstein認為,當水熊蟲處于極端的壓力條件(如干燥條件或極端干燥)時,水熊蟲的DNA斷裂成小碎片。當細胞補充水份時,細胞膜和細胞核(DNA的保存之處),變得暫時泄漏,DNA和其他大分子可容易地通過。當細胞補充水分后,水熊蟲不僅可以修復自己受損的DNA,而且也將來自不同物種的DNA嵌入自己的基因組中。
Boothby說:“我們想起生命樹,遺傳物質從親本垂直傳遞下來。但是隨著基因水平轉移這個概念越來越被廣泛接受,并且更廣為人知,至少在某些生物體中,它正開始改變我們思考‘進化和遺傳物質傳遞以及基因組穩定性’的方式。因此,我們不是考慮生命之樹,而是可以考慮生命之網,以及從分支到分支的遺傳物質交換。所以這是令人興奮的。我們開始調整對于進化過程的理解。”
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