垂體性閉經是由于垂體病變致使Gn分泌降低而引起的閉經。
1.垂體腫瘤
位于蝶鞍內的腺垂體中各種腺細胞均可發生腫瘤，最常見的是分泌PRL的腺瘤，閉經程度與PRL對下丘腦GnRH分泌的抑制程度有關。若發生在青春期前，則可引起原發性閉經。根據腫瘤的性質不同，臨床上可有溢乳、巨人癥、皮質醇增多癥等腫瘤所特有的癥狀，還可出現頭痛、視力障礙、視野缺損等神經受壓的癥狀。
2.空蝶鞍綜合征
由于蝶鞍隔先天性發育不全，或腫瘤及手術破壞蝶鞍隔，使充滿腦脊液的蛛網膜下腔向垂體窩（蝶鞍）延伸。壓迫腺垂體，使下丘腦分泌的GnRH和多巴胺經垂體門脈循環向垂體的轉運受阻，從而導致閉經，可伴PRL水平升高和溢乳。
3.先天性垂體病變
先天性垂體病變包括單一Gn分泌功能低下的疾病和垂體生長激素缺乏癥；前者可能是LH或FSH的α、β亞單位分子結構異常或其受體異常所致；后者則是由于腦垂體前葉生長激素分泌不足所致。
4.Sheehan綜合征
Sheehan（席漢）綜合征是由于產后出血和休克導致的腺垂體急性梗死和壞死，可引起腺垂體功能低下，從而出現低血壓、畏寒、嗜睡、食欲減退、貧血、消瘦、產后無泌乳、脫發及低Gn性閉經。