藥片應和液體一起整片吞服，而不應當咀嚼或壓碎。
對于存在吞咽困難的患者，可將片劑溶于半杯不含碳酸鹽的水中（不應使用其他液體，因腸溶包衣可能被溶解），攪拌，直至片劑完全崩解，立即或在30分鐘內服用，再加入半杯水漂洗后飲用。微丸決不應被嚼碎或壓破。
對于不能吞咽的患者，可將片劑溶于不含碳酸鹽的水中，并通過胃管給藥。重要的是應仔細檢查選擇的注射器和胃管的合適程度。準備工作及使用指導如下 ：
通過胃管給藥 ：
1. 將片劑放入合適的注射器，并加入約25 mL水及5 mL空氣。有時需要50 mL水，以防止管子被微丸堵塞。
2. 立即振搖注射器約2分鐘使片劑溶解。
3. 使注射器尖端朝上，檢查尖端未被堵塞。
4. 將注射器插入管，并保持此位置。
5. 振搖注射器，使尖端朝下。立即注射5-10 mL入管。注射后翻轉注射器并振搖（注射器必須保持尖端朝上，以免尖端堵塞）。
6. 使注射器尖端朝下，立即再向管中注射5-10 mL，重復此步驟，直到注射器中無液體。
7. 如需要洗下注射器剩余的殘留物，重復步驟5，向注射器中加入25 mL水及5 mL空氣，有時需要50 mL水。
胃食管反流性疾病(GERD)
-糜爛性反流性食管炎的治療
40mg，每日1次，連服四周。
對于食管炎未治愈或持續有癥狀的患者建議再服藥治療四周。
已經治愈的食管炎患者防止復發的長期維持治療20mg每日1次。
-胃食管反流性疾病的癥狀控制
沒有食管炎的患者20mg每日一次。如果用藥4周癥狀未獲控制，應對患者作進一步的檢查。一旦癥狀消除，隨后的癥狀控制可采用按需療法，即需要時口服20mg，每日一次。
與適當的抗菌療法聯合用藥根除幽門螺桿菌，并且
-愈合與幽門螺桿菌相關的十二指腸潰瘍
-預防與幽門螺桿菌相關的消化性潰瘍復發
埃索美拉唑鎂腸溶片20mg+阿莫西林1g+克拉霉素500mg，每日二次，共7天。