龜鱉類有著漫長且成功的演化歷史,是形態學上最為特化的爬行動物之一。全球共有龜鱉類動物13科、89屬、270余種,被分為兩個特征明確的支系 ——側頸龜亞目和曲頸龜亞目。中華鱉和綠海龜分別是曲頸龜中鱉類和海龜類的典型代表,對其進行基因組學研究,有助于理清龜鱉類系統發育及其軀體進化機制。
日前,由深圳華大基因研究院、日本理化研究所發育生物學中心、英國桑格研究所等合作完成的中華鱉、綠海龜基因組研究成果,日前在線發表于《自然—遺傳學》雜志。該研究從基因組水平揭示了龜鱉軀體發育進化歷程,為深入研究基因組DNA作為指導胚胎發生的“藍圖”提供了新線索。
此次研究人員對中華鱉和綠海龜進行了全基因組測序、組裝注釋。系統發育分析發現,龜鱉類很可能是鱷類和鳥類共同祖先的姐妹群,并形成一種推測,即龜鱉類的出現是否和當時海洋動物的滅絕有關。該研究還對龜鱉類特異性基因進行了初步分析,發現在中華鱉和綠海龜基因組中均呈現出嗅覺受體家族的高度擴張。同時,研究揭示,龜鱉許多與味覺感知相關的基因都發生了丟失,調控饑餓刺激和能量調節激素的胃促生長素也發生了丟失,這可能與龜鱉低代謝的生活方式相關。
研究還發現,Wnt5a在中華鱉背甲生長帶表達,這支持了中華鱉先形成古老的脊椎動物軀體模式、然后再形成中華鱉特異的新特征的觀點。在該過程中,肢體相關的Wnt信號可能發生了共選擇,這為中華鱉背甲的形成研究提供了線索。
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