多序列比對的目標是什么？

多序列比對的目標是使得參與比對的序列中有盡可能多的列具有相同的字符，即使得相同殘基的位點位于同一列，這樣以便于發現不同的序列之間的相似部分，從而推斷它們在結構和功能上的相似關系，主要用于分子進化關系，預測蛋白質的二級結構和三級結構、估計蛋白質折疊類型的總數，基因組序列分析等。