近日，中科院大連化學物理研究所王方軍博士、鄒漢法研究員等人在高通量多重蛋白質組定量分析方法研究方面取得新進展，發展了一級質譜(MS1)譜圖中六種不同蛋白質樣品同時規模化定量分析的同位素標記方法，并將該方法應用于細胞蛋白質合成-降解周轉更新分析，分析通量是常規同位素標記方法的三倍，研究成果發表在自然出版社新創立的綜合性刊物《科學報告》(Scientific Reports, 2013, 3, 1827. doi: 10.1038/srep01827)上。
基于一級質譜(MS1)的蛋白質組學定量分析由于定量精度高，是現今蛋白質組學定量分析中應用最為廣泛的分析技術。由于同位素標記的限制，現有的方法最多可以在一次液相色譜-質譜聯用分析中定量三種不同的蛋白質樣品，極大限制了蛋白質組學定量分析的通量。王方軍博士、鄒漢法研究員等人將體內氨基酸同位素標記方法與體外二甲基化同位素標記方法進行有機組合，實現了六種不同蛋白質樣品的差異標記并在單次實驗中實現了相對定量分析。該六重同位素標記策略還可以應用于細胞中蛋白質的合成及降解速率的高通量分析，成功測定了HeLa細胞中1365個蛋白質的合成-降解周轉更新時間。此外，該工作中使用的基于MS1六重蛋白質組學定量及蛋白質周轉分析軟件系統也由我所自主開發，是國際上首個可以同時定量六個不同蛋白質樣品的軟件系統。
Quant-ArMone 六重蛋白質組學定量及蛋白質周轉分析軟件示意圖
HeLa細胞內蛋白質降解動態擬合曲線示例
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