大腸埃希菌可以通過多種途徑感染人體。 最常見的感染途徑是通過攝入受污染的食物或水。這可能包括未煮熟的肉類、污染的蔬菜、水果或飲用水。此外，人與人之間也可以通過接觸傳播，例如通過受污染的手或物品表面。
在特定的條件下，大腸埃希菌還可以通過其他方式感染人體，例如通過插入性醫療操作、插管或膀胱鏡檢查等。新生兒也可能通過分娩時接觸受感染的母親而獲得大腸埃希菌感染。
