染色反應：革蘭氏陽性菌在染色過程中會保留紫色的晶紫染料，而革蘭氏陰性菌則會失去紫色染料，被染成紅色或粉紅色。
細胞壁結構：革蘭氏陽性菌的細胞壁較厚，主要由多層肽聚糖和肽聚糖間的肽鏈組成，而革蘭氏陰性菌的細胞壁較薄，由一層薄的肽聚糖和外膜組成。
細胞壁通透性：革蘭氏陽性菌的細胞壁通透性較低，不易被外界物質滲透，而革蘭氏陰性菌的細胞壁通透性較高，容易被外界物質滲透。
抗生素敏感性：由于革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌的細胞壁結構和通透性不同，它們對抗生素的敏感性也不同。一般來說，革蘭氏陽性菌對青霉素等β-內酰胺類抗生素敏感，而革蘭氏陰性菌則對氨基糖苷類抗生素敏感。