主要與硬下疳，軟下疳鑒別：
硬下疳為單個質硬的潰瘍，無疼痛感，無復發史，實驗檢查USR(+)或RPR(+)，梅毒螺旋體可見。
軟下疳為質軟的潰瘍，局部雖有疼痛感但無復發史，實驗檢查鏈桿菌陽性。
其他生殖器部位皮膚病如接觸性帶狀皰疹、白塞病。膿皰病有時與生殖器皰疹相似，可以從病史及檢查方面相區別。
