SLE患者多為緩慢起病，隨著所累及的器官系統不同，主訴及癥狀亦有不同，大多數患者有全身癥狀包括發熱、疲倦、乏力、體重減輕和周身不適。出現骨骼肌肉癥狀，包括嚴重關節疼痛，表現為對稱性關節炎，半數有關節晨僵，肌肉疼痛、乏力，嚴重者肌肉萎縮。患者有血液系統改變，包括貧血、溶血、白細胞減少、血小板減少、血清中有狼瘡抗凝物,皮膚損害，突出的特點是面部蝶形紅斑，分布于鼻及雙頰部，少數紅斑也見于其他部位，紅斑稍微水腫，日曬后加重。肢端可有小結節及雷諾現象，皮膚彈力差。可以有脫發，口腔潰瘍。部分SLE患者有精神、神經癥狀。輕者僅有心理障礙，嚴重者發生癲癇、偏癱或蛛網膜下腔出血等。60%患者有心、肺改變，出現心肌炎時，胸悶、心悸、氣短、不能平臥，心臟擴大，甚至于發生心力衰竭。SLE病變累及漿膜時，出現心包炎、胸膜炎，胸腔積液、呼吸困難、胸痛。發生肺纖維化，又稱狼瘡肺，有腎炎表現時，出現蛋白尿，管型尿，晚期進展為腎病綜合征及腎功能衰竭，表現為血壓升高、水腫，45%患者有胃腸表現，如食欲減退、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉。少數患者出現血管栓塞，肢體疼痛，可出現足背動脈消失。