如今,無創產前檢測(NIPT)正受到更多孕婦的青睞。不過,荷蘭的一個研究團隊最近通過這項檢測發現了母體10號染色體的缺失及相關的脆性位點擴增,這可能導致NIPT的檢測結果為假陽性。
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研究人員篩選了數千名孕婦的NIPT結果,發現了10號染色體缺失的異常結果。這項檢測利用單端測序,旨在檢測胎兒的21、18和13號染色體三體,以及> 10 Mb的亞染色體異常。通過隨訪分析,研究人員發現8名婦女存在10號染色體缺失和FRA10B脆性位點的擴增。
盡管胎兒未檢測到缺失,研究人員警告說,母體的缺失和擴增可能很容易被錯誤歸為胎兒的10號染色體缺失。阿姆斯特丹自由大學醫學中心的Erik Sistermans及其同事在《Genetics in Medicine》上發表了這一成果,提醒人們注意假陽性的結果。
“這對臨床隨訪有著嚴重的影響,因為侵入性檢測原本是不必要的,”他們解釋說,認為母體的FRA10B脆性位點擴增“應當被歸到那些可能造成假陽性NIPT結果的母體基因組變異中”。
研究團隊收集2,527個NIPT結果并通過Wisecondor算法分析,確定了兩例20 Mb的10號染色體缺失。隨后,他們又追蹤到6個存在類似的10號染色體缺失的病例。
研究人員對其中四例的羊水樣本進行芯片檢測,但并未發現胎兒DNA存在可疑缺失。此外,他們還對胎盤或臍帶血樣本開展熒光原位雜交(FISH)或SNP芯片分析,也未檢測到任何缺失。
直到后來,研究人員利用FISH來檢測母體淋巴細胞中的脆性位點FRA10B,才發現了這個NIPT異常結果的根源。在部分細胞中,這個脆性位點的擴增伴隨著10號染色體端粒信號的丟失。之后,他們又利用比較基因組芯片對兩名孕婦的全血樣本進行驗證。
研究人員指出,缺失只發生在十分之一的檢測細胞中。另外,三名孕婦并沒有檢測到10號染色體的缺失,這也許是因為芯片錯過了低水平的嵌合,他們解釋說。
“如果染色體缺失恰好從FRA10B開始,那么它很可能是由母體的嵌合型缺失引起,”作者在文中寫道。“盡管這個脆性位點還沒有任何已知的表型,但我們建議通過母體檢測來確認NIPT的篩查結果。”
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