安捷倫科技將 CGH 和 SNP 分析結合到同一芯片上
創造出一款獨具特色的細胞遺傳學工具
2010 年 10 月 11 日,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日推出 SurePrint G3 Human CGH+SNP 芯片平臺,這一創新型的系統能夠同時分析染色體拷貝數改變和不改變的染色體畸變。該系統可以幫助科研人員研究發育性疾病以及多種癌癥的遺傳機理。
這是目前市場上唯一檢測雜合性丟失和單親二倍體(LOH/UPD)的雙色 CGH 分析平臺,分辨率可達 5 至 10兆堿基。
貝勒醫學院分子人類遺傳學系主任 Arthur Beaudet 博士說,“我們終于擁有一款芯片,它不僅具有最佳的拷貝數檢測能力,可以覆蓋所有外顯子,而且還具有 SNP 分析能力,可以檢測由 UPD 或近親結婚引起的雜合性缺失 [LOH]。”
安捷倫 CGH 芯片產品經理 Anniek De Witte 表示,“我們將 SNP 探針加入到已經被廣泛使用的 安捷倫CGH 芯片設計中,開發出一款可以同時有效檢測拷貝數變化及無拷貝數變化的 LOH/UPD 的強大工具,進而獲得更詳細和完整的基因組畸變圖譜,對此我們相當興奮。相比我們以前推出的 CGH 芯片,這一新產品的分辨率、準確性和靈敏度同樣出色,絕不會讓研究者失望。”
安捷倫 SurePrint G3 CGH+SNP 芯片提供目錄版和定制版,與我們目前的芯片形式類似。您可通過安捷倫免費的eArray在線工具或eArray XD 單機版輕松完成定制芯片的設計。
SurePrint CGH+SNP 4x180K 和 2x400K 兩款型號的芯片均可檢測大約 60000 個 SNP,因此,檢測整個基因組的 LOH/UPD 時分辨率可達到約 5 至 10 兆堿基。4x180K芯片上的約 120000 個 CGH 探針,由包括細胞遺傳學芯片國際標準聯合會 (ISCA,) 推薦的8x60K 檢測芯片中所有的探針以及額外的 60000 個骨架探針組成。2x400K 芯片上的約 300000 個 CGH 探針覆蓋了基因組最重要的區域,側重于基因和外顯子。
SurePrint G3 CGH+SNP 芯片使用與現有的CGH單一檢測芯片相同的高通量工作流程,因此能夠簡單高效地應用于細胞遺傳學研究。安捷倫的Genomic Workbench軟件采用創新算法,利用 CGH 探針計算拷貝數變化,通過 SNP 探針測定等位基因特異性拷貝數以及定位 LOH/UPD 區域,彌補了現有芯片分析的不足。該軟件可以同時分析 CGH 和 SNP 數據,計算QC參數,并以此確保高可信度的數據評估。
關于安捷倫科技公司
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