對核小體進行高分辨率模擬，揭開其復雜堆積

　　日本京都大學(Kyoto University)細胞材料綜合科學研究所(iCeMS)的科學家開發了一種技術，可以對人類基因組的一個基本單元——核小體——進行高分辨率模擬。他們的研究結果發表在Nature Protocols雜志上，應該有助于加深對核小體折疊變化如何影響基因內部工作的理解。

　　核小體是細胞核內DNA包裝的基本結構單位。它們是由纏繞在少量組蛋白周圍的DNA構成的。核小體在細胞核內四處移動，折疊和展開，改變它們的方向，靠近或遠離。這些運動影響了DNA中各種分子的可及性，決定了基因何時以及如何開啟和關閉。

　　領導這項研究的iCeMS系統生物學家Yuichi Taniguchi解釋說:“3D基因組結構為細胞中的基因表達過程提供了物理分子基礎。”

　　為了更好地可視化這種結構，Taniguchi和他的同事開發了Hi-CO，即核小體取向的高通量染色體構象捕獲。它建立在現有的Hi-C技術的基礎上，顯著提高了分辨率，以便模擬顯示樣品中分析的每個核小體的三維位置和方向。

　　“能夠分析這種結構應該有助于澄清許多生物現象的起源和控制原理，包括細胞分化和免疫，”分子生物學家Masae Ohno說。

　　Hi-CO需要一個月的時間，在這個過程中，酶和各種其他分子被用來處理生物體的基因組，最終將其DNA分解成數百萬個片段，這些片段由于核小體的接近而彼此接近。然后，這些片段被測序，數據被輸入模擬程序，顯示每個核小體最可能的方向。

　　Taniguchi和他的團隊成功地在酵母基因組上測試了Hi-CO。他們打算下一步用它來分析其他生物體的基因組，同時繼續改進這項技術。他們還希望利用Hi-CO研究各種細胞分化狀態和疾病中的基因組結構。